Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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