Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Med28Q920D3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms