Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms