Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms