Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms