Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms