Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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