Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpap2Q8VC34 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms