Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms