Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms