Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casc3Q8K3W3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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