Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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