Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms