Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms