Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc87Q8CDL9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc87Q8CDL9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc87Q8CDL9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc87Q8CDL9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc87Q8CDL9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc87Q8CDL9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc87Q8CDL9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc87Q8CDL9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc87Q8CDL9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc87Q8CDL9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms