Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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