Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc159Q8C963 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc159Q8C963 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms