Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms