Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lin9Q8C735 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lin9Q8C735 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lin9Q8C735 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lin9Q8C735 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lin9Q8C735 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lin9Q8C735 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lin9Q8C735 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lin9Q8C735 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lin9Q8C735 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lin9Q8C735 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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