Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms