Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc113Q8C5T8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms