Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssuh2Q8C3L1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms