Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms