Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trub1Q8C0D0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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