Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms