Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms