Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pum3Q8BKS9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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