Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nop53Q8BK35 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nop53Q8BK35 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nop53Q8BK35 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nop53Q8BK35 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nop53Q8BK35 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nop53Q8BK35 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nop53Q8BK35 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nop53Q8BK35 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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