Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

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Length 893 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbbp8Q80YR6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp8Q80YR6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp8Q80YR6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rbbp8Q80YR6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp8Q80YR6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp8Q80YR6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp8Q80YR6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rbbp8Q80YR6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp8Q80YR6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rbbp8Q80YR6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rbbp8Q80YR6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp8Q80YR6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rbbp8Q80YR6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp8Q80YR6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rbbp8Q80YR6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp8Q80YR6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rbbp8Q80YR6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rbbp8Q80YR6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rbbp8Q80YR6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rbbp8Q80YR6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp8Q80YR6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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