Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Alkbh8Q80Y20 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms