Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Zbed4Q80WQ9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Zbed4Q80WQ9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zbed4Q80WQ9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zbed4Q80WQ9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zbed4Q80WQ9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zbed4Q80WQ9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zbed4Q80WQ9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zbed4Q80WQ9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zbed4Q80WQ9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zbed4Q80WQ9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zbed4Q80WQ9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms