Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Npm2Q80W85 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Npm2Q80W85 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Npm2Q80W85 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Npm2Q80W85 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Npm2Q80W85 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Npm2Q80W85 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Npm2Q80W85 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Npm2Q80W85 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
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