Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lamp3Q7TST5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms