Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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