Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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