Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms