Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Trappc6aQ78XR0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Trappc6aQ78XR0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6aQ78XR0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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