Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snd1Q78PY7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms