Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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