Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms