Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms