Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tfap2eQ6VUP9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms