Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx13Q6PHS6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms