Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RimklaQ6PFX8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms