Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms