Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gpbp1l1Q6NZP2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms