Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Sohlh1Q6IUP1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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