Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms