Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop58Q6DFW4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms