Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms